Né en 1927 dans la préfecture de Nagano, fils de l’abbé du temple de Ryuto-in, il est diplômé de l’Université Bouddhiste de Komazawa, la grande université du bouddhisme japonais.
Puis il entre à l’âge de 22 ans au temple de Eiheiji pour une période de formation et devient abbé de Ryuto-in à l’âge de 25 ans. Il partage sa vie entre Eiheiji, Ryuto-in et Tokyo, où il est membre de l’Assemblée de l’école Sôtô, l’une des grandes écoles du bouddhisme japonais.
Au cours des années ’70, il rencontre au Japon maître Deshimaru, qui souhaitait s’établir au temple de Sekkyuji dans la préfecture de Nagano et il lui en facilite l’accès.
En tant que représentant du Zen Sôtô et du bouddhisme japonais, il rencontre le Pape Paul VI à Rome en 1982. La même année, il accompagne au temple de la Gendronnière le Rév. Hatha Zenji, abbé du temple de Eiheiji.
En 1992, il devient Kannin (Grand Administrateur) de Eiheiji. En 2004, il est nommé abbé du temple de Chuôji à Sapporo, l’un des temples principaux du bouddhisme japonais en Hokkaido.
Il retourne en 2001 à la Gendronnière à la tête d’une grande délégation de Eiheiji, afin d’y célébrer le 750ème anniversaire de l’entrée de maître Dôgen dans le nirvana.
Il y rencontre Taiun Jean-Pierre Faure, à cette époque responsable de la Gendronnière, qui deviendra son disciple et l’aidera à fonder le monastère bouddhiste zen Kanshoji en Dordogne (France).
En 2003, il donne la transmission du Dharma à son premier disciple européen,Taiun Faure, qui devient abbé du monastère Kanshoji en 2011.
En 2008, il donne la transmission du Dharma à Hosetsu Laure Scemama, sa deuxième disciple européenne, responsable du Centre Zen de Limoges et qui aida à la fondation de Kanshoji, dont elle est actuellement vice-abbesse.
En 2016, il préside les grandes cérémonies d’O-Jukai au temple de la Gendronnière, dont Taiun Faure Roshi est à l’époque abbé. C’est la première fois qu’Ojukai – l’une des grandes cérémonies du bouddhisme japonais dans la forme du zen Sôtô – a lieu en Europe. Il reviendra en juin 2019 présider ces mêmes cérémonies à Kanshoji.
Il revient chaque année (ou presque) en Europe. C’est ainsi que se sont noués au fil des ans des liens forts entre Dônin Minamisawa Zenji et le zen européen.
Le 4 avril 2021, il devient Zenji (abbé) de Eiheiji.
Minamisawa Zenji a toujours eu un grand respect pour la mission que Taisen Deshimaru Roshi a initiée en Europe et il croit fortement à l’avenir du zen Sôtô européen. Le lien qu’il a créé avec ses disciples européens, avec le monastère de Kanshoji et le temple de la Gendronnière se renforce d’année en année. Il œuvre avec foi et diligence pour le développement du zen en Europe.